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    작성일 : 17-01-31 14:58
    생존분석에서의 interaction term 관련 여쭙습니다.
     글쓴이 : 양욱진
    조회 : 6,452  
    R 프로그램, survival 패키지의 coxph를 활용하여 Cox proportional hazards model로 생존 분석을 하고 있습니다. 


    분석에 포함된 두 변수 간의 interaction term을 분석에 포함시키고자 하는데 몇 가지 질문이 있어 여쭙습니다. 



    1.

    coxph(TS~A*B,data=data)

    위 식에서 A와 B는 각각 4개의 group으로 구분된 범주형 변수입니다. 

    이 둘의 multiplicative interaction term인 A*B를 넣어 분석을 했을 때 아래와 같이 여러 경우의 interaction term이 출력되는데요


                coef      exp(coef) se(coef)      z       p


    A2:B2 -0.090925  0.913087  0.151353 -0.60   0.548

    A3:A2 -0.033619  0.966939  0.141383 -0.24   0.812

    A4:B2  0.056397  1.058017  0.134474  0.42   0.675

    A2:B3 -0.000475  0.999525  0.186385  0.00   0.998

    ....


    이와 같이 출력되었을 때 두 범주형 변수 사이의 interaction 확인을 이와 같이 하는 것이 맞을지,

    그렇다면 A, B interaction term의 p-value는 저 여러 값들 중 어떤 값으로 봐야 하는지, 

    또 저렇게 여러 개로 출력되는 interaction term의 p-value 중 하나만 유의하게 (<0.05) 나와도 A와 B 사이에 유의한 interaction이 있다고 봐야 하는지가 궁금합니다. 



    2.

    A*B, A*C, A*D 등 주요 관심 대상인 변수 A와 여러 가지 변수(B, C, D)의 interaction term을 확인하는 경우에는 최종 모델에 어떻게 반영을 하는지가 궁금합니다. 


    예를 들어 모든 covariate를 포함하는 최종 모델식이 coxph(TS~A+B+C+D+E+F,data=data)이고 A*B, A*C, A*D를 1번의 식에 넣고 각각 돌리니 A*C, A*D의 interaction만 유의하게 나왔다고 할 때,


    최종 모델에도 유의한 interaction term을 넣어 coxph(TS~A*C+B+A*D+E+F,data=data) 의 식을 채택하는 것이 맞을지

    아니면 interaction term 검정은 coxph(TS~A*B,data=data)와 같이 대상이 되는 변수만 넣고 돌려서 interaction 여부만 언급해주고 최종 모델은 coxph(TS~A+B+C+D+E+F,data=data1) 그대로 결과를 내는 것이 맞을지가 혼란스럽습니다. 



    바쁘신 중 감사드립니다!


    통계학술연구회 17-01-31 17:41
    답변  
    안녕하세요. SA입니다.
    1. 각 문항별 관계성을 모두 풀어서 상호작용을 본 것으로 이해됩니다.
    예를 들어, 분산분석만 하느냐, 분산분석 후 사후검정을 하느냐로 이해하면 될 듯 합니다.
    분산분석은 처리에 대한 전체적인 의미를 담고 있지만, 사후분석은 개별적인 집단 간 차이를 다시 검정하는 것이기 때문에 분산분석의 결과와 상이할 수 있습니다.

    2. 접근방법으로 이해됩니다만, 주효과와 상호작용을 같이 확인하는 방식이 대체로 많이 쓰이는 것으로 알고 있습니다. 이는 주효과 뿐만아니라 개별적인 상호작용 효과도 전체 효과의 일부분이기 때문으로 이해 됩니다.

    감사합니다.
     
     

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